La qualità ambientale può essere valutata utilizzando il biomonitoraggio di suolo, acqua e aria considerando che la diversità dei macroinvertebrati di suolo e acqua e la biodiversità delle comunità dei licheni epifiti decresce rapidamente quando suolo, acqua e aria sono alterate da diverse cause, come inquinamento, uso di pesticidi sintetici e biologici, cattive pratiche agricole, ecc.
Alcuni organismi sono particolarmente adatti a rilevare alterazioni più o meno pesanti dell’ambiente in cui vivono, in quanto presentano elevata sensibilità verso gli inquinanti, larga diffusione sul territorio, bassa mobilità e capacità di accumulare sostanze inquinanti nei loro tessuti. Per questo, essi possono essere considerati indicatori biologici ed essere utilizzati nella valutazione della qualità di suolo, acqua e aria anche negli ambienti agrari.
Sulla base di questi principi World Biodiversity Association ha messo a punto gli Indici di Biodiversità di Suolo, Acqua, Aria del protocollo Biodiversity Friend.



